Анани Стойнев завършва философия в СУ през 1976 г. Специализира във Вършава и Киев. Работи в Института по философия при БАН от 1977 г. От 1992 г. завежда Секция История на философията и е главен редактор на сп. "Философски алтернативи". Защитил е дисертациите: "Елементи на религиозно-митологическите комплекси на прабългари и славяни", "Св. Иван Рилски, официалното християнство и богомилство". Автор е на "Светогледът на прабългарите", "Българските славяни. Митология и религия", "Философско-исторически размишления".